Ngày 13/4/2015, Bộ Y tế ban hành Quyết định số 1294/QĐ-BYT quy định Quy chế tổ chức và hoạt động của Bệnh viện Phong - Da liễu Trung ương Quỳnh Lập với chức năng là Cung cấp dịch vụ khám bệnh, chữa bệnh, phòng bệnh và phục hồi chức năng cho người bệnh phong, người bệnh da liễu, người bệnh HIV/AIDS ở tuyến cao nhất của khu vực Bắc Trung Bộ và các bệnh đa khoa khác; tổ chức nghiên cứu khoa học, đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, viên chức và chỉ đạo tuyến về lĩnh vực chuyên môn của bệnh viện theo sự phân công của cấp có thẩm quyền và theo quy định của pháp luật. Trải qua 60 năm xây dựng và trưởng thành, Bệnh viện Phong - Da liễu Trung ương Quỳnh Lập luôn hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ mà Đảng, Nhà nước giao phó, đó là tập trung điều trị, chăm sóc và nuôi dưỡng người bệnh phong, đã tiếp nhận trên 3.000 bệnh nhân phong, điều trị khỏi bệnh và xuất viện trên 1.700 bệnh nhân, trong đó có 540 quân nhân, 373 cán bộ, viên chức, 93 bệnh nhân quốc tịch Lào, trên 1.000 lượt bệnh nhân được phục hồi tàn tật bằng phẫu thuật chỉnh hình, trên 3.500 bệnh nhân cụt chân được cấp chân giả và hàng ngàn bệnh nhân được cấp nạng nẹp, xe lăn...

Hiện tại tổ chức bộ máy của Bệnh viện gồm có Ban Giám đốc, 08 phòng chức năng, 09 khoa Lâm sàng và 05 khoa Cận Lâm sàng với tổng số là 296 công chức, viên chức và người lao động, biên chế là 214/220, trong đó trên đại học là 18 người, cao đẳng, đại học là 135 người, trung cấp là 77 người, còn lại là công nhân kỹ thuật, lái xe, điện nước... là 67 người. Công tác khám, chữa bệnh ngày càng được quan tâm, cải thiện. Ngoài chuyên khoa da liễu, có nhiều chuyên khoa khác được thành lập như khoa sản, nhi, mắt, răng hàm mặt, tai mũi họng; phục hồi chức năng... Các dịch vụ cận lâm sàng được đầu tư như các thiết bị: máy xét nghiệm, nội soi, siêu âm, chụp X.Quang, điện tim, điện não, máy laser... Nhân lực được đào tạo nâng cao tay nghề, số lần khám bệnh của nhân dân hàng năm đều tăng lên đáng kể, nhân dân đã tin tưởng và uy tín của bệnh viện ngày càng được nâng cao.

Định hướng phát triển đến năm 2020 và tầm nhìn 2030 Phát triển Bệnh viện thành Bệnh viện chuyên sâu, khám, chữa bệnh, phòng bệnh và phục hồi chức năng cho người bệnh phong, người mắc bệnh da liễu, người HIV/AIDS ở tuyến cao nhất của khu vực Bắc Trung Bộ và khám, chữa bệnh đa khoa khác. Có cơ sở vật chất, trang thiết bị hiện đại đáp ứng nhu cầu khám, chữa bệnh cho nhân dân trong khu vực; phấn đấu trở thành Bệnh viện chuyên khoa hạng I.[1]